После соучастия советских войск в попытке переворота в Вильнюсе 13 января 1991 года Председатель ВС РСФСР Ельцин заявил, хотя и в вопросительной форме, что России может быть придется создавать собственную армию (или национальную гвардию). 31 января 1991 комитет по взаимодействию был преобразован в Госкомитет РФ по обороне и безопасности, который возглавил К.И.Кобец. 5 мая 1991 госкомитет был разделен на Госкомитет РСФСР по делам обороны и КГБ РСФСР. При формировании нового правительства 30 июля 1991 Государственный комитет РСФСР по делам обороны переименован в Государственный комитет РСФСР по оборонным вопросам.
Должность министра обороны впервые была введена в РСФСР 19 августа 1991 года временно до восстановления в полном объеме деятельности конституционных органов государственной власти и управления. Министром обороны назначен Председатель Госкомитета РСФСР по оборонным вопросам Константин Иванович КОБЕЦ. 9 сентября должность министра была упразднена, а до этого, 23 августа 1991, председателем госкомитета по оборонным вопросам был назначен отличившийся при путче П.С.Грачев. Правда указ о назначении Грачева был подписан президентом СССР Горбачевым, а подтверждающий указ Ельцина появился только 29 октября 1991.
5 декабря 1991 года, в преддверии подписания Беловежских соглашений Президент Б.Н.Ельцин издал указ о повышении на 90% размеров окладов военнослужащих Министерства обороны СССР, указ содержал также разрешение Министерству обороны самостоятельно устанавливать размеры окладов, доплат и надбавок. Министр обороны СССР маршал авиации Е.И.Шапошников признал Беловежские соглашения сразу же после их подписания 8 декабря 1991. 21 декабря 1991 одновременно с присоединением к Содружеству независимых государств 8 республик (всех, кроме Грузии и ранее покинувших СССР республик Прибалтики) был подписан протокол о возложении на Шапошникова командования Вооруженными силами "до их реформирования". 14 февраля 1992 главы 9 государств СНГ назначили Шапошникова Верховным главнокомандующим Объединенными вооруженными силами (ОВС) СНГ. Министерство обороны СССР стало называться Главным командованием (Главкоматом) ОВС СНГ.
http://www.politika.su/prav/minobor.html